Лаборатория микробиологии - лабораторные исследования, анализ крови, анализ мочи, генетические исследования – медицинская лаборатория накфф. Группа иммунологических исследований. В каждой лаборатории предусмотрены

Заведующий лабораторией врач высшей квалификационной категории
Калугина Елена Юрьевна

(ЛКМ) располагается в лабораторном корпусе ФГБУ «ЦКБ с поликлиникой» УД Президента РФ. Лаборатория клинической микробиологии выполняет классические микробиологические исследования, а также диагностику инфекционных и неинфекционных заболеваний молекулярно-биологическими методами.

Классические методы диагностики инфекционных заболеваний включают:

Бактериологические исследования (культивирование и идентификация) условно-патогенных аэробных, факультативно-анаэробных микроорганизмов и облигатно-анаэробных микроорганизмов - возбудителей гнойно-септических и оппортунистических заболеваний в различных видах биологического материала (кровь , спинно-мозговая жидкость , моча, кал, желчь, отделяемое дыхательных путей, отделяемое мочеполовых органов, грудное молоко, раневое отделяемое, отделяемое полостей);
Определение чувствительности выделенной микрофлоры к антибактериальным препаратам и бактериофагам (вирусам бактерий);
Идентификацию микроорганизмов - возбудителей острых кишечных инфекций ;
Исследования по определению состояния микробиоценоза кишечника (дисбактериоз);
Микологические исследования ;
Иммунологические исследования по определению антител к возбудителям инфекционных заболеваний и антигенов возбудителей инфекционных заболеваний.

На базе ЛКМ организован Центр молекулярно-биологических исследований .

В задачи Центра входит диагностика инфекционных и неинфекционных заболеваний молекулярно-биологическими методами.

Молекулярно-биологические исследования позволяют определять (в том числе количественно) широкий спектр возбудителей инфекционных заболеваний:

Возбудителей ИППП ;
Вирусов герпеса (вирусы простого герпеса, вирус ветряной оспы, цитомегаловирус, вирус Эпштейна-Барр и др.);
Вирусов - возбудителей острых респираторных вирусных инфекции (вирусы гриппа, парагриппа, аденовирус, риновирус, метапневмовирус и др.);
Возбудителей острых кишечных инфекций (ротавирусы, норовирусы, астровирусы, аденовирусы, шигеллы, сальмонеллы, эшерихии, кампилобактер);
Вирусов гепатитов и ВИЧ;
Интегральная оценка состояния микрофлоры влагалища.

Диагностика неинфекционных заболеваний молекулярно-биологическими методами основана на выявлении генов, ответственных за развитие того или иного заболевания, или генов, определяющих предрасположенность к развитию заболеваний.

Генетический анализ предрасположенности к развитию тромбозов . Исследование необходимо всем, кто готовиться к хирургической операции; женщинам, планирующим беременность, при назначении гормональной контрацепции или гормональной заместительной терапии; пациентам со злокачественными образованиями.

Для пациентов, которые нуждаются в проведении антикоагулянтной терапии (лечение и профилактика тромбозов), возможно проведение генетического исследования по подбору индивидуальной дозы варфарина.

Выявление носительства HLA-B27 антигена - современный подход в диагностике аутоиммунных заболеваний.

Большинство молекулярно-генетических исследований выполняется в день обращения.

Ежегодно лаборатория принимает участие в Федеральной системе внешней оценки качества клинических лабораторных исследований (ФСВОК).

Лаборатория клинической микробиологии оснащена современным, высокотехнологичным оборудованием. Для работы применяются наборы реагентов и питательные среды ведущих отечественных и зарубежных производителей.

Штат лаборатории представлен сертифицированными специалистами: врачами-бактериологами, врачами клинической лабораторной диагностики, фельдшерами лаборантами. Большинство специалистов лаборатории имеют высшую и первую квалификационные категории.

Врачи лаборатории являются экспертами Федеральной системы внешней оценки качества клинических лабораторных исследований (ФСВОК).

Лаборатория является учебной базой УНМЦ УД Президента РФ и «Медицинского колледжа» Управления делами Президента Российской Федерации. Врачи лаборатории осуществляют преподавательскую деятельность на курсах повышения квалификации для среднего персонала по специальности «Лабораторная диагностика». Врачи лаборатории регулярно принимают участие в научно-практических конференциях, организуемых учреждениями здравоохранения Управления делами Президента Российской Федерации, во Всероссийских конференциях по лабораторной диагностике.

Приоритетными направлениями деятельности лаборатории клинической микробиологии являются:

Обеспечение и контроль качества микробиологических исследований на всех этапах лабораторного исследования (преаналитический, аналитический, постаналитический);
Совместная работа с врачами-клиницистами по оптимизации алгоритмов обследования пациентов с применением микробиологических методов диагностики;
Внедрение в работу лаборатории современных методов диагностики возбудителей инфекционных заболеваний.
Сокращение сроков проведения лабораторных исследований за счет применения высоких технологий.
Расширение спектра молекулярно-биологических исследований для диагностики генетически-обусловленных заболеваний (предрасположенностей).

Заведующий лабораторией клинической микробиологии - врач высшей квалификационной категории Калугина Елена Юрьевна

В качестве самостоятельного подразделения Института педиатрии лаборатория микробиологии появилась в 1998 году. Более 15 лет лаборатория обслуживает все подразделения Научного Центра здоровья детей, выполняя более 25000 микробиологических анализов в год. В настоящее время в работу лаборатории, базирующуюся на принципах классической клинической микробиологии, внедрены новые методы исследования, которые основаны на последних достижениях молекулярно-генетических и масс-спектрометрических технологий.

Лаборатория микробиологии специализируется на выполнении медицинской бактериологической диагностики, отвечающей современным международным стандартам качества.

Бактериологические исследования являются одним из основных инструментов для постановки инфекционного диагноза и дают врачу 70% значимой информации об инфекционном агенте. В настоящее время в современном мире большое внимание уделяется микробиологической диагностике инфекционных процессов, включающей выявление этиологически значимого микроорганизма и определение его чувствительности к широкому спектру антимикробных препаратов. Именно на этих знаниях основана современная адекватная эмпирическая и этиотропная антибактериальная терапия.

Особенно ценны данные микробиологического исследования в отделениях реанимации и интенсивной терапии для выявления возбудителей внутрибольничной инфекции и сепсиса.

Технологии включают автоматизированную идентификацию микроорганизмов с определением спектра их устойчивости к антибиотикам на баканализаторах, выявление генов резистентности бактерий методом полимеразной цепной реакции, идентификацию микроорганизмов на основе MALDI-TOF-масс-спектрометрии, автоматизированную оценку культуральных признаков микробов.

Лаборатория аккредитована на проведение микробиологических исследований с микроорганизмами III-IV групп патогенности.

Лаборатория участвует в проведении внешней оценки качества лабораторных исследований (ФСВОК).

С 2014 года лаборатория участвует в международном проекте проведении оценки качества (UK NEQAS).

Лаборатория участвует в глобальных программах по мониторингу антибиотикорезистентности актуальных возбудителей, проводимых под эгидой НИИ антимикробной химиотерапии (НИИАХ) ГОУ ВПО «Смоленская государственная медицинская академия Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию», Межрегиональная ассоциация по клинической микробиологии и антимикробной химиотерапии (МАКМАХ) и Научно-методический центр Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию по мониторингу антибиотикорезистентности (ЦМАР).

В лаборатории проводятся исследования по выделению, идентификации и определению чувствительности к антибиотикам патогенных и условно патогенных микроорганизмов, изолированных из различных биоматериалов.

В лаборатории микробиологии выполняются следующие виды анализов:

бактериологическое исследование мокроты, трахеального аспирата, промывных вод бронхов;
бактериологическое исследование отделяемого из различных очагов воспаления: тонзилло-фарингиты, отиты, синуситы и др.;
бактериологическое исследование крови (гемокультура) и ликвора;
бактериологическое исследование экссудатов;
бактериологическое исследование отделяемого со слизистой оболочки зева и носа на условно патогенную микрофлору;
бактериологическое исследование мочи с определением степени бактериурии и идентификацией возбудителя;
исследование фекалий на патогенную кишечную флору;
бактериологическое исследование грудного молока;
оценка чувствительности/устойчивости изолированных микроорганизмов к антибиотикам.

С 2015 года отдел микробиологии сертифицирован Всемирной Организаций Здравоохранения как Центр передового опыта Сети супра-национальных референс-лабораторий ВОЗ.

Руководитель — д.б.н., профессор Лариса Николаевна Черноусова в отделе микробиологии работают 2 доктора и 5 кандидатов наук, врачи-бактериологи, врачи клинической лабораторной диагностики.

Основные направления деятельности отдела микробиологии:

Фундаментальные исследования: направлены на изучение биологических свойств M.tuberculosis, их вирулентности, особенностей выживания в эукариотических клетках, взаимодействия патоген-хозяин в зависимости от кластерной принадлежности M.tuberculosis, изучение механизмов развития лекарственной устойчивости и путей распространения и передачи как M.tuberculosis различных генетических кластеров, так и нетуберкулезных микобактерий.
Изучение роли различных видов микроорганизмов в патогенезе заболеваний органов дыхания (стафилококков, стрептококков, нейссерий бактерий рода Haemophilus, коринеформных бактерий, энтеробактерий, неферментирующих грамотрицательных бактерий, в частности атипичных и беспегментных псевдомонад, а также различных видов рода Pseudomonas, сходных по морфологическим и биохимическим свойствам с Р.aeruginosa.
Прикладные исследования: направлены на автоматизацию процедур молекулярно-генетической и микробиологической диагностики туберкулеза, апробацию и внедрение инновационных диагностических тест-систем, оценка их значимости для практической фтизиатрии, разработки новых подходов к видовой идентификации туберкулезных и нетуберкулезных микобактерий, испытания противотуберкулезной активности новых синтетических и природных соединений в отношении лабораторных и клинических штаммов M.tuberculosis в экспериментах in vitro и ex vivo.
Совершенствование методологических приемов выделения, идентификации, определения свойств бактериальных штаммов и их резистентности к антибиотикам, серологическое типирование культур пневмококков иммунными сыворотками, ацидометрический метод определения β- лактомаз, метод определения адгезивной способности бактерий.
Клинические исследования направлены на обнаружение туберкулезных и нетуберкулезных микобактерий и определение их лекарственной чувствительности; бактериологическую диагностику заболеваний органов дыхания нетуберкулезной этиологии, а также сопутствующей патологии у больных туберкулезом.
Организационно-методическая работа представлена участием в курации региональных специализированных бактериологических лабораторий с целью совершенствования качества микробиологических исследований и инфекционного контроля в противотуберкулезных учреждениях, разработкой нормативных документов, руководств и научно-методических рекомендаций, преподавательской и экспертной деятельностью.

Отдел микробиологии включает 3 лаборатории:

Лаборатория микробиологической диагностики туберкулеза

зав. — к.б.н. Е.Е. Ларионова

Бактериоскопия диагностического материала на наличие кислотоустойчивых бактерий
Посев диагностического материала на плотной питательной среде и жидкой питательной среде в автоматической системе ВАСТЕС MGIT
Определение лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза к ПТП 1-го и 2-го ряда в автоматической системе ВАСТЕС MGIT
Определение лекарственной чувствительности МБТ к пиразинамиду PZA в автоматической системе ВАСТЕС MGIT
Определение лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза к линезолиду, ПАСК, моксифлоксацину на жидкой питательной среде в автоматической системе ВАСТЕС MGIT
Выявление и определение лекарственной чувствительности нетуберкулезных микобактерий

Лаборатория молекулярно-генетических методов исследования

зав. проф. Л.Н.Черноусова

Выполняет следующие исследования:

Выявление ДНК МБТ методом ПЦР в режиме реального времени из диагностического материала
Определение чувствительности МБТ к RIF и INH методом ПЦР в режиме реального времени из диагностического материала
Выявление ДНК МБТ и определение ЛЧ к RIF в картридже GeneXpert MTB\RIF
Определение чувствительности к RIF, INH, FQ, AG\CP и EMB на ДНК-стрипах из диагностического материала
Идентификация культур на род Mycobacterium методом ПЦР
Определение вида туберкулезных и нетуберкулезных микобактерий на ДНК-стрипах

Лаборатория неспецифической микрофлоры (зав. — к.м.н. Л.Г. Селина)

Выполняет:

Микробиологическую диагностику облигатно-аэробных, факультативно-анаэробных, микроанаэрофильных микроорганизмов для ранней диагностики гнойно-воспалительных осложнений и выбора оптимальной лечебной тактики.
Исследование нарушений состояния нормальной микрофлоры кишечника при туберкулезе и других заболеваниях органов дыхания, разработка методов их коррекции (бактериологическое исследование содержимого толстого кишечника на дисбактериоз).
Лаборатория выполняет весь объем исследований у больных стационара и пациентов консультативно-поликлинического отделения института.
- Исследуются следующие виды патологического материала:
- мокрота, промывные воды бронхов, пунктаты инфильтратов или абсцесса легких, бронхиальные смывы, аспираты, плевральные экссудаты, отделяемое лимфоузлов, свищей, открытые инфицированные раны, спинномозговая жидкость;
- мазки из зева, миндалин, носовой полости (на носительство Staphylococcus aureus и при подозрении на Klebsiella sрpecies, а так же при различных инфекциях носа и глотки;
- отделяемое глаз (коньюктива, край век, роговица), ушей, при заболеваниях полости рта, языка, зубов, кусочки органов и тканей, кровь и гной при аутопсии;
- кровь при подозрении на бактериемию и сепсис (ускоренный метод), количественное исследование бактерий в моче (выявление бактериурии), исследование содержимого толстого кишечника на дисбактериоз.
Применение новейших методов бактериологической диагностики (в частности «Микра-ла-тестов», индикаторных бактериологических систем, а также ручной и автоматизированной идентификационной системы BBL Crystal) позволяет идентифицировать до 500 видов различных микроорганизмов. Санитарно-бактериологический раздел представлен исследованиями воздуха в центральном стерилизационном отделении, в отделе эндоскопии, смывов с предметов окружающей среды и обстановки, рук и одежды персонала, а также в проверке качества стерильных растворов, приготовленных в аптеке института.

Сотрудники отдела микробиологии

Севастьянова Элина Викторовна

Доктор биологических наук, ведущий научный сотрудник

Окончила в 1986 году с отличием Московский ордена Трудового Красного Знамени технологический институт пищевой промышленности по специальности «Технология микробиологических и витаминных производств».
С 1994 года работает в отделе микробиологии ЦНИИТ. Проходила обучение по программам поддержанным ВОЗ, CDC, МФОКК, Eagleson Institute, FILHA, IUATLD.
Преподаватель обучающих курсов ЦНИИТ, куратор региональных лабораторий по диагностике туберкулеза, секретарь тематической рабочей группы «Лабораторная диагностика туберкулеза» при Рабочей группе высокого уровня по туберкулезу в РФ при МЗ РФ и ВОЗ, член экспертной группы при ФСВОК по специальности микробиологическая диагностика туберкулеза.
Основные направления работы: разработка оптимальных принципов организации работы лабораторной сети для диагностики туберкулеза; анализ деятельности лабораторий и совершенствование системы обеспечения качества микробиологических исследований; инфекционный контроль в противотуберкулезных учреждениях и обеспечение биологической безопасности в специализированных бактериологических лабораториях; разработка нормативных документов, руководств и научно-методических рекомендаций; преподавательская и экспертная деятельность.
Автор более 90 печатных работ, в том числе – 6 Учебных пособий, 3 Федеральных клинических рекомендаций, 2 Руководства, 1 Методические рекомендации для врачей, 1 Методическое пособие для врачей.

Смирнова Татьяна Геннадьевна

Кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник

Окончила Российский государственный медицинский Университет в 1998 г. медико-биологический факультет, кафедра биохимии, специализация – молекулярная биология.
Основные и смежные специальности: врач-биохимик, микробиология, врач клинической лабораторной диагностики.
Работает в ФГБНУ «ЦНИИТ» в отделе микробиологии, в лаборатории молекулярно-генетических методов исследований с 1998 года. Сотрудник центра передового опыта Сети супра-национальных референс-лабораторий ВОЗ. Преподаватель обучающих курсов ЦНИИТ по вопросам микробиологической и молекулярно-генетической диагностики туберкулеза и микобактериальных инфекций, специалист по обучению работе на автоматизированной системе BACTEC MGIT 960, эксперт по лабораторной диагностике фтизиатрического профиля, один из разработчиков нормативных документов.
Область научных и клинических интересов: специалист в области микробиологической и молекулярно-генетической диагностики туберкулеза и определения лекарственной чувствительности микобактерий, генотипирование штаммов M.tuberculosis complex (сполиготипирование, RFLP IS6110), совершенствование диагностики инфекций, вызванных нетуберкулезными микобактериями, масс-спектрометрический анализ белковых профилей микобактерий туберкулезного комплекса, нетуберкулезных микобактерий и неспецифической флоры, разработка методов определения противотуберкулезной активности вновь синтезированных субстанций in vitro и ex vivo.
Автор более 75 статей в зарубежных и отечественных журналах, в том числе 1-го учебного пособия и 3-х методических рекомендаций.

Старший научный сотрудник, кандидат медицинских наук

Основная и смежные специальности: врач-биохимик, микробиология, врач клинической лабораторной диагностики.
Окончила медико-биологический факультет, кафедру биохимии Российского государственного медицинского Университета в 1998 г., специализация – молекулярная биология.
Работает в ФГБНУ «ЦНИИТ» в отделе микробиологии, в лаборатории молекулярно-генетических методов исследования с 1998 г. Сотрудник центра передового опыта Сети супра-национальных референс-лабораторий ВОЗ.
Область научных интересов: молекулярная эпидемиология, генотипирование штаммов M.tuberculosis, внутривидовое разнообразие M.tuberculosis, биологические свойства штаммов микобактерий в зависимости от кластерной принадлежности, распространенность генетических кластеров M.tuberculosis, трансмиссивность и вирулентность микобактерий туберкулеза, взаимодействие патоген–хозяин, модельные исследования остро прогрессирующего туберкулеза, мета-анализ данных по генотипированию и лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза, определение противотуберкулезной активности химических соединений in vitro и ex vivo, микробиологическая и молекулярно-генетическая диагностика туберкулеза и микобактериозов.
Автор более 57 статей в отечественных и зарубежных журналах, в том числе 1 учебного пособия и 3 методических рекомендаций.

Кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник

Пузанов Владимир Алексеевич

Куликовская Надежда Ивановна Лаборант