Mikrobiologické laboratórium - laboratórne testy, krvné testy, rozbor moču, genetické testy - lekárske laboratórium nakff. Imunologická výskumná skupina. Každé laboratórium poskytuje

Vedúci laboratórneho lekára najvyššej kvalifikačnej kategórie
Elena Yurievna Kalugina

(LKM) sa nachádza v budove laboratória Federálnej štátnej rozpočtovej inštitúcie „Centrálna klinická nemocnica s poliklinikou“ Administrácie prezidenta Ruskej federácie. Laboratórium klinickej mikrobiológie vykonáva klasické mikrobiologické štúdie, ako aj diagnostiku infekčných a neinfekčných ochorení molekulárno-biologickými metódami.

Klasické metódy diagnostiky infekčných chorôb zahŕňajú:

Bakteriologické štúdie (kultivácia a identifikácia) oportúnnych aeróbnych, fakultatívne anaeróbnych mikroorganizmov a obligátnych anaeróbnych mikroorganizmov - pôvodcov hnisavých-septických a oportúnnych ochorení v rôznych druhoch biologického materiálu (krv, cerebrospinálnej tekutiny, moč, výkaly, žlč, výtok z dýchacích ciest, výtok z urogenitálnych orgánov, materské mlieko, výtok z rany, výtok z dutín);
Stanovenie citlivosti izolovanej mikroflóry na antibakteriálne liečivá a bakteriofágy (bakteriálne vírusy);
Identifikácia mikroorganizmov - pôvodcovia akútnych črevných infekcií;
Štúdie na určenie stavu črevnej mikrobiocenózy (dysbióza);
Mykologický výskum;
Imunologické štúdie na stanovenie protilátok proti patogénom infekčných chorôb a antigénov patogénov infekčných chorôb.

Na základe LKM usporiadal Centrum pre molekulárno-biologický výskum.

Medzi úlohy centra patrí diagnostika infekčných a neinfekčných ochorení molekulárno-biologickými metódami.

Molekulárne biologické štúdie umožňujú určiť (aj kvantitatívne) širokú škálu patogénov infekčných chorôb:

STI patogény;
Herpes vírusy (vírusy herpes simplex, vírus ovčích kiahní, cytomegalovírus, vírus Epstein-Barrovej atď.);
Vírusy - pôvodcovia akútnych respiračných vírusových infekcií (vírusy chrípky, parainfluenzy, adenovírusy, rinovírusy, metapneumovírusy atď.);
Pôvodcovia akútnych črevných infekcií (rotavírusy, norovírusy, astrovírusy, adenovírusy, shigella, salmonela, escherichia, campylobacter);
Vírusy hepatitídy a HIV;
Integrálne hodnotenie stavu vaginálnej mikroflóry.

Diagnostika neinfekčných ochorení molekulárno-biologickými metódami je založená na identifikácii génov zodpovedných za vznik konkrétneho ochorenia, prípadne génov, ktoré určujú predispozíciu k rozvoju ochorení.

Genetická analýza predispozície k rozvoju trombózy... Štúdia je potrebná pre každého, kto sa pripravuje na chirurgickú operáciu; ženy plánujúce tehotenstvo pri predpisovaní hormonálnej antikoncepcie alebo hormonálnej substitučnej liečby; pacientov so zhubnými nádormi.

U pacientov, ktorí potrebujú antikoagulačnú liečbu (liečba a prevencia trombózy), je možné vykonať genetickú štúdiu výber individuálnej dávky warfarínu.

Detekcia nosiča antigénu HLA-B27 je moderným prístupom v diagnostika autoimunitných ochorení.

Väčšina molekulárno-genetických štúdií sa vykonáva v deň liečby.

Laboratórium sa každoročne zapája do Federálneho systému externého hodnotenia kvality klinického laboratórneho výskumu (FSVOK).

Laboratórium klinickej mikrobiológie je vybavené moderným špičkovým vybavením. Na prácu sa používajú reagenčné súpravy a kultivačné médiá od popredných domácich a zahraničných výrobcov.

Laboratórny personál zastupujú atestovaní odborníci: bakteriológovia, lekári klinickej laboratórnej diagnostiky, sanitári, laboranti. Väčšina laboratórnych špecialistov má najvyššiu a prvú kvalifikačnú kategóriu.

Lekári laboratória sú odborníkmi Federálneho systému externého hodnotenia kvality klinického laboratórneho výskumu (FSVOK).

Laboratórium je školiacou základňou pre UNMC UD prezidenta Ruskej federácie a „Lekárske kolégium“ administratívneho oddelenia prezidenta Ruskej federácie. Lekári laboratória vykonávajú pedagogickú činnosť v doškoľovacích kurzoch pre stredný personál v odbore "Laboratórna diagnostika". Lekári laboratória sa pravidelne zúčastňujú na vedeckých a praktických konferenciách organizovaných zdravotníckymi zariadeniami Správneho odboru prezidenta Ruskej federácie, na celoruských konferenciách o laboratórnej diagnostike.

Prioritné oblasti činnosti Laboratóriá pre klinickú mikrobiológiu sú:

Zabezpečenie a kontrola kvality mikrobiologického výskumu na všetkých stupňoch laboratórneho výskumu (preanalytický, analytický, postanalytický);
Spolupráca s klinickými lekármi pri optimalizácii algoritmov vyšetrenia pacienta pomocou mikrobiologických diagnostických metód;
Implementácia moderných metód diagnostiky patogénov infekčných chorôb v laboratóriu.
Skrátenie času na laboratórny výskum pomocou špičkových technológií.
Rozšírenie spektra molekulárno-biologických štúdií na diagnostiku geneticky podmienených chorôb (predispozícií).

Vedúci Laboratória klinickej mikrobiológie- lekárka najvyššej kvalifikačnej kategórie Kalugina Elena Yurievna

Mikrobiologické laboratórium vzniklo v roku 1998 ako samostatný útvar Ústavu detských chorôb. Laboratórium už viac ako 15 rokov slúži všetkým divíziám Vedeckého centra pre zdravie detí a ročne vykoná viac ako 25 000 mikrobiologických rozborov. V súčasnosti sú do práce laboratória zavedené nové výskumné metódy, založené na princípoch klasickej klinickej mikrobiológie, ktoré sú založené na najnovších pokrokoch v molekulárno-genetických a hmotnostných spektrometrických technológiách.

Mikrobiologické laboratórium sa špecializuje na vykonávanie lekárskej bakteriologickej diagnostiky, ktorá spĺňa moderné medzinárodné štandardy kvality.

Bakteriologické štúdie sú jedným z hlavných nástrojov na stanovenie infekčnej diagnózy a poskytujú lekárovi 70% významných informácií o pôvodcovi infekcie. V súčasnosti sa v modernom svete venuje veľká pozornosť mikrobiologickej diagnostike infekčných procesov vrátane identifikácie etiologicky významného mikroorganizmu a stanovenia jeho citlivosti na široké spektrum antimikrobiálnych liečiv. Práve na týchto poznatkoch je založená moderná adekvátna empirická a etiotropná antibakteriálna liečba.

Údaje z mikrobiologického výskumu na jednotkách intenzívnej starostlivosti sú obzvlášť cenné pre identifikáciu pôvodcov nozokomiálnej infekcie a sepsy.

Technológie zahŕňajú automatizovanú identifikáciu mikroorganizmov s určením spektra ich rezistencie voči antibiotikám pomocou bakteriologických analyzátorov, detekciu génov bakteriálnej rezistencie metódou polymerázovej reťazovej reakcie, identifikáciu mikroorganizmov na základe hmotnostnej spektrometrie MALDI-TOF, automatizované hodnotenie kultúrnych znakov mikróbov.

Laboratórium je akreditované na vykonávanie mikrobiologických štúdií s mikroorganizmami III-IV skupín patogenity.

Laboratórium sa podieľa na externom hodnotení kvality laboratórneho výskumu (FSVOK).

Od roku 2014 sa laboratórium zúčastňuje medzinárodného projektu hodnotenia kvality (UK NEQAS).

Laboratórium sa podieľa na globálnych programoch monitorovania antibiotickej rezistencie lokálnych patogénov vedených pod záštitou Výskumného ústavu antimikrobiálnej chemoterapie (NIIAC) GOU VPO „Smolenská štátna lekárska akadémia Federálnej agentúry pre zdravie a sociálny rozvoj“, Medziregionálna asociácia pre klinickú mikrobiológiu a Metodické centrum antimikrobiálnej chemoterapie Federálnej agentúry pre zdravie a sociálny rozvoj pre monitorovanie rezistencie na antibiotiká (CMAR).

Laboratórium vykonáva výskum izolácie, identifikácie a stanovenia antibiotickej citlivosti patogénnych a oportúnnych mikroorganizmov izolovaných z rôznych biomateriálov.

V mikrobiologickom laboratóriu sa vykonávajú tieto typy analýz:

bakteriologické vyšetrenie spúta, tracheálneho aspirátu, bronchiálnej výplachovej vody;
bakteriologické vyšetrenie výtoku z rôznych ložísk zápalu: tonzilofaryngitída, zápal stredného ucha, sinusitída atď.;
bakteriologické vyšetrenie krvi (krvná kultúra) a cerebrospinálnej tekutiny;
bakteriologické vyšetrenie exsudátov;
bakteriologické vyšetrenie výtoku zo sliznice hltana a nosa na podmienene patogénnu mikroflóru;
bakteriologické vyšetrenie moču s určením stupňa bakteriúrie a identifikáciou patogénu;
vyšetrenie výkalov na patogénnu črevnú flóru;
bakteriologické vyšetrenie materského mlieka;
posúdenie citlivosti/rezistencie izolovaných mikroorganizmov na antibiotiká.

Od roku 2015 je Katedra mikrobiológie certifikovaná Svetovou zdravotníckou organizáciou ako Centrum excelentnosti pre sieť nadnárodných referenčných laboratórií WHO.

Školiteľom je doktorka biologických vied profesorka Larisa Nikolaevna Chernousova, na oddelení mikrobiológie pracujú 2 lekári a 5 kandidátov vied, bakteriológovia, doktori klinickej laboratórnej diagnostiky.

Hlavné činnosti Katedry mikrobiológie:

Základný výskum: sú zamerané na štúdium biologických vlastností M. tuberculosis, ich virulenciu, charakteristiky prežívania v eukaryotických bunkách, interakciu patogén-hostiteľ v závislosti od klastra patriace k M. tuberculosis, štúdium mechanizmov vzniku liekovej rezistencie a spôsobov šírenia a prenosu M. aj netuberkulóznych mykobaktérií.
Štúdium úlohy rôznych typov mikroorganizmov v patogenéze respiračných ochorení (stafylokoky, streptokoky, baktérie Neisseria rodu Haemophilus, koryneformné baktérie, enterobaktérie, nefermentujúce gramnegatívne baktérie, najmä atypické a nepigmentované pseudomony, napr. ako aj rôzne druhy rodu Pseudomonas s podobnými biochemickými vlastnosťami P. aeruginosa.
Aplikovaný výskum: sú zamerané na automatizáciu postupov molekulárno-genetickej a mikrobiologickej diagnostiky tuberkulózy, schvaľovanie a implementáciu inovatívnych diagnostických testovacích systémov, hodnotenie ich významu pre praktickú ftizeológiu, vývoj nových prístupov k druhovej identifikácii tuberkulóznych a netuberkulóznych mykobaktérií, testovanie antituberkulotik aktivita nových syntetických a prírodných zlúčenín vo vzťahu k laboratórnym a klinickým kmeňom M. tuberculosis v experimentoch in vitro a ex vivo.
Zdokonaľovanie metodických techník izolácie, identifikácie, určovania vlastností bakteriálnych kmeňov a ich rezistencie voči antibiotikám, sérologická typizácia kultúr pneumokokov imúnnymi sérami, acidometrická metóda stanovenia β-laktomáz, metóda určovania adhezívnych schopností baktérií .
Klinické výskumy zamerané na detekciu tuberkulóznych a netuberkulóznych mykobaktérií a určenie ich citlivosti na lieky; bakteriologická diagnostika respiračných ochorení netuberkulóznej etiológie, ako aj sprievodná patológia u pacientov s tuberkulózou.
Organizačná a metodická práca reprezentovaná účasťou na supervízii regionálnych špecializovaných bakteriologických laboratórií za účelom skvalitnenia mikrobiologického výskumu a kontroly infekcií v protituberkulóznych ústavoch, vypracúvaním regulačných dokumentov, smerníc a vedecko-metodických odporúčaní, pedagogickej a expertnej činnosti.

Mikrobiologické oddelenie zahŕňa 3 laboratóriá:

Laboratórium na mikrobiologickú diagnostiku tuberkulózy

hlavu - Ph.D. JA. Larionovej

Bakterioskopia diagnostického materiálu na prítomnosť acidorezistentných baktérií
Výsev diagnostického materiálu na pevnú živnú pôdu a tekutú živnú pôdu v automatickom systéme VASTES MGIT
Stanovenie liekovej citlivosti mycobacterium tuberculosis na lieky 1. a 2. línie proti TBC v automatickom systéme VASTES MGIT
Stanovenie liekovej citlivosti ordinácie na pyrazínamid PZA v automatickom systéme VASTES MGIT
Stanovenie liekovej citlivosti mycobacterium tuberculosis na linezolid, PASK, moxifloxacín na tekutom živnom médiu v automatickom systéme VASTES MGIT
Identifikácia a stanovenie liekovej citlivosti netuberkulóznych mykobaktérií

Laboratórium pre molekulárne genetické metódy výskumu

hlavu Prednášal prof. L.N.Černoušová

Vykonáva nasledujúci výskum:

Detekcia MBT DNA pomocou real-time PCR z diagnostického materiálu
Stanovenie citlivosti MBT na RIF a INH pomocou PCR v reálnom čase z diagnostického materiálu
Detekcia MBT DNA a stanovenie LP až RIF v kazete GeneXpert MTB \ RIF
Stanovenie citlivosti na RIF, INH, FQ, AG \ CP a EMB na DNA prúžkoch z diagnostického materiálu
Identifikácia kultúr rodu Mycobacterium pomocou PCR
Stanovenie typu tuberkulóznych a netuberkulóznych mykobaktérií na DNA prúžkoch

Laboratórium nešpecifickej mikroflóry (vedúci - kandidát lekárskych vied L.G. Selina)

Vykonáva:

Mikrobiologická diagnostika obligátne-aeróbnych, fakultatívne-anaeróbnych, mikroanaerofilných mikroorganizmov pre včasnú diagnostiku pyozápalových komplikácií a voľbu optimálnej terapeutickej taktiky.
Vyšetrovanie porúch stavu normálnej črevnej mikroflóry pri tuberkulóze a iných ochoreniach dýchacieho systému, vývoj metód na ich nápravu (bakteriologické vyšetrenie obsahu hrubého čreva na dysbiózu).
Laboratórium realizuje celý objem výskumu u pacientov nemocnice a pacientov konziliárno-poliklinického oddelenia ústavu.
- Vyšetrujú sa tieto typy patologického materiálu:
- spútum, bronchiálna výplachová voda, bodkovité infiltráty alebo pľúcny absces, bronchiálne výplachy, aspiráty, pleurálne exsudáty, výtok z lymfatických uzlín, fistuly, otvorené infikované rany, cerebrospinálny mok;
- výtery z hltana, mandlí, nosovej dutiny (na prenášanie Staphylococcus aureus a na podozrenie na druhy Klebsiella, ako aj na rôzne infekcie nosa a hltana;
- výtok z oka (spojivka, okraj viečok, rohovka), uši, pri ochoreniach ústnej dutiny, jazyka, zubov, kúskov orgánov a tkanív, krvi a hnisu pri pitve;
- krv pri podozrení na bakteriémiu a sepsu (zrýchlená metóda), kvantitatívne štúdium baktérií v moči (zistenie bakteriúrie), štúdium obsahu hrubého čreva na dysbiózu.
Použitie najnovších metód bakteriologickej diagnostiky (najmä "Micra-la-testy", indikátorové bakteriologické systémy, ako aj manuálny a automatizovaný identifikačný systém BBL Crystal) umožňuje identifikovať až 500 druhov rôznych mikroorganizmov. Sanitárnu a bakteriologickú sekciu predstavuje výskum ovzdušia na oddelení centrálnej sterilizácie, na oddelení endoskopie, výplachov z predmetov životného prostredia a prostredia, rúk a odevov personálu, ako aj pri kontrole kvality sterilných roztokov pripravovaných v lekárni ústavu. .

Pracovníci Katedry mikrobiológie

Sevastjanová Elina Viktorovna

Doktor biologických vied, vedúci výskumník

V roku 1986 absolvovala s vyznamenaním Moskovský rád Červeného praporu práce, Technologický inštitút potravinárskeho priemyslu so špecializáciou na technológiu mikrobiologickej výroby a výroby vitamínov.
Od roku 1994 pracuje na oddelení mikrobiológie Ústredného vedecko-výskumného ústavu mikrobiologického. Bola vyškolená v programoch podporovaných WHO, CDC, IFRC, Eagleson Institute, FILHA, IUATLD.
Učiteľ vzdelávacích kurzov na TsNIIT, kurátor regionálnych laboratórií pre diagnostiku tuberkulózy, tajomník tematickej pracovnej skupiny "Laboratórna diagnostika tuberkulózy" v pracovnej skupine na vysokej úrovni pre tuberkulózu v Ruskej federácii pod Ministerstvom zdravotníctva Ruska federácie a WHO, člen expertnej skupiny pri FSVOK so špecializáciou na mikrobiologickú diagnostiku tuberkulózy.
Hlavné oblasti práce: vývoj optimálnych princípov organizácie práce laboratórnej siete na diagnostiku tuberkulózy; analýza laboratórnych činností a zlepšenie systému zabezpečenia kvality pre mikrobiologický výskum; kontrola infekcií v protituberkulóznych ústavoch a zaistenie biologickej bezpečnosti v špecializovaných bakteriologických laboratóriách; vývoj normatívnych dokumentov, smerníc a vedeckých a metodických odporúčaní; pedagogická a znalecká činnosť.
Autor viac ako 90 publikácií, vrátane 6 učebníc, 3 federálnych klinických smerníc, 2 smerníc, 1 smerníc pre lekárov, 1 smerníc pre lekárov.

Smirnová Tatiana Gennadevna

Kandidát lekárskych vied, vedúci výskumník

V roku 1998 ukončil štúdium na Ruskej štátnej lekárskej univerzite, Lekársko-biologická fakulta, Katedra biochémie, špecializácia - molekulárna biológia.
Základné a príbuzné odbory: lekár-biochemik, mikrobiológia, doktor klinickej laboratórnej diagnostiky.
Od roku 1998 pracuje vo Federálnom štátnom rozpočtovom vedeckom ústave „TsNIIT“ na oddelení mikrobiológie, v laboratóriu molekulárno-genetických výskumných metód. Člen v Centre excelentnosti siete nadnárodných referenčných laboratórií WHO. Lektor vzdelávacích kurzov na TsNIIT o mikrobiologickej a molekulovo genetickej diagnostike tuberkulózy a mykobakteriálnych infekcií, špecialista na školenia na automatizovanom systéme BACTEC MGIT 960, odborník na laboratórnu diagnostiku ftizeológie, jeden z tvorcov regulačných dokumentov.
Výskumné a klinické záujmy: špecialista v oblasti mikrobiologickej a molekulovo genetickej diagnostiky tuberkulózy a stanovenia liekovej citlivosti mykobaktérií, genotypizácia komplexných kmeňov M. tuberculosis (spoligotypizácia, RFLP IS6110), zlepšenie diagnostiky infekcií spôsobených netuberkulóznymi mykobaktériami , hmotnostná spektrometrická analýza profilov mykobaktérií tuberkulózneho komplexu, neteberkulóznych mykobaktérií a nešpecifickej flóry, vývoj metód na stanovenie protituberkulóznej aktivity novosyntetizovaných látok in vitro a ex vivo.
Autor viac ako 75 článkov v zahraničných a domácich časopisoch, vrátane 1 študijnej príručky a 3 metodických odporúčaní.

Vedúci výskumník, kandidát lekárskych vied

Hlavné a príbuzné odbory: biochemik, mikrobiológia, lekár klinickej laboratórnej diagnostiky.
Absolvoval Lekársku a biologickú fakultu, Katedru biochémie Ruskej štátnej lekárskej univerzity v roku 1998, špecializácia - molekulárna biológia.
Od roku 1998 pôsobí vo Federálnom štátnom rozpočtovom vedeckom ústave „TsNIIT“ na oddelení mikrobiológie, v laboratóriu metód molekulárno-genetického výskumu. Je zamestnancom centra excelentnosti Siete nadnárodných referenčných laboratórií hl. SZO.
Výskumné záujmy: molekulárna epidemiológia, genotypizácia kmeňov M. tuberculosis, vnútrodruhová diverzita M. tuberculosis, biologické vlastnosti kmeňov mykobaktérií v závislosti od klastrovej príslušnosti, prevalencia genetických zhlukov M. tuberculosis, prenosnosť a virulencia mycobacterium tuberculosis, interakcia patogén-hostiteľ, modelovanie progresívnej tuberkulózy, metaanalýza údajov o genotypizácii a liekovej citlivosti mycobacterium tuberculosis, stanovenie antituberkulóznej aktivity chemických zlúčenín in vitro a ex vivo, mikrobiologická a molekulárno-genetická diagnostika tuberkulózy a mykobakteriózy.
Autor viac ako 57 článkov v domácich a zahraničných časopisoch, vrátane 1 študijnej príručky a 3 metodických odporúčaní.